根據不同典籍記載,中外的古文化都有使用音樂治療病痛的做法,及至一些原始民族及宗教儀式之中,亦能看到音樂治療的影子。後來「醫學」與「音樂」分別向科學及藝術方向發展,兩者似乎變成了兩門南轅北轍的學問。直至二戰時期,音樂被發現對於促進治療及康復非常有效,並引起了學者的興趣,音樂與醫學的關係開始重新被重視。二十世紀中後期起,西方各國開始成立相關專業團體,於不同臨床領域中廣泛使用音樂治療,並以科學方式研究其功效。
時至今日,音樂治療已發展成一套有系統及科學的心理治療方法,治療師會於治療開始前及結束後,分別為服務使用者的治療需要以及治療效果作專業評估,並作後續建議。所有治療師必須於認可學府完成專業訓練,後於相關專業團體註冊並受監管,以保證治療師的專業操守及質素。